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【中國科學(xué)報】跨越10萬(wàn)年,他們用“指紋”解鎖中國水稻演化史
2024-05-27 | 作者: | 【 】【打印】【關(guān)閉

來(lái)源:中國科學(xué)報 發(fā)布日期:2024-5-26??作者:馮麗妃

5月24日,距離杭州約120公里的浙江省浦江縣,藍天白云下,稻田環(huán)繞間,上山遺址迎來(lái)一個(gè)重要發(fā)現。

中國科學(xué)院地質(zhì)與地球物理研究所(以下簡(jiǎn)稱(chēng)地質(zhì)地球所)研究員呂厚遠、張健平,與浙江省文物考古研究所、臨沂大學(xué)等13個(gè)國內外單位的合作者,利用水稻“指紋”——植硅體微化石中的魚(yú)鱗紋數量等手段,解鎖了水稻從野生到馴化的10萬(wàn)年連續演化史。研究進(jìn)一步確認了中國是世界水稻的起源地,距今約1萬(wàn)年前的上山文化在其中占據重要地位。相關(guān)研究發(fā)表于《科學(xué)》。

“證據確鑿,結論高度創(chuàng )新。”國際審稿人評價(jià)說(shuō),這項研究深入探討了水稻在中國的漫長(cháng)演化歷史,改變了人們對世界農業(yè)起源格局的認識,可以說(shuō)是迄今為止東亞水稻起源最全面的論證,具有很高的學(xué)術(shù)價(jià)值。

“這是一個(gè)科學(xué)的突破,更是一個(gè)文明的啟示。”地質(zhì)地球所所長(cháng)底青云說(shuō),小麥、水稻的起源,是人類(lèi)發(fā)展歷史的重要里程碑。上山文化遺址中水稻馴化的證據表明,東亞稻作農業(yè)與西亞兩河流域麥作農業(yè)的起源在時(shí)間上是同步的,這大大深化了對世界農業(yè)起源格局的理解,也為增強民族文化自信做出了重要貢獻。


上山遺址。上山遺址中心張國萍供圖

缺失的證據鏈

水稻是全球半數人口的主食。但人類(lèi)最早從什么時(shí)候、在什么地方種水稻、吃稻米,開(kāi)始農業(yè)起源?

過(guò)去一個(gè)多世紀來(lái),這個(gè)問(wèn)題一直充滿(mǎn)爭議。印度起源說(shuō)、東南亞起源說(shuō)、阿薩姆和云南起源說(shuō),各類(lèi)假說(shuō)紛紛擾擾。

直到20世紀70年代,浙江余姚河姆渡遺址、浦江上山遺址以及長(cháng)江中下游諸多遺址水稻考古證據的發(fā)現,才讓國際學(xué)術(shù)界開(kāi)始認同長(cháng)江中下游地區可能是世界水稻的重要起源地之一。

“但直到21世紀初,學(xué)術(shù)界認可的農業(yè)起源地是中南美洲和西亞,不包括東亞。”論文共同第一兼通訊作者呂厚遠對《中國科學(xué)報》說(shuō),“水稻栽培和馴化對中華文明的形成和發(fā)展產(chǎn)生了深遠的影響。但至今,中國一些大學(xué)的教材里還在講水稻是印度起源的。”

國際上,中南美洲和西亞分別被認為是玉米和小麥馴化地。東亞稻作農業(yè)起源緣何不被認可呢?

其關(guān)鍵問(wèn)題是,缺少化石證據。

傳統觀(guān)點(diǎn)認為,距今2.65萬(wàn)至1.9萬(wàn)年前的末次盛冰期因為溫度降低,在長(cháng)江中下游是沒(méi)有野生稻分布的。“如果沒(méi)有野生稻,馴化從哪兒來(lái)?”呂厚遠說(shuō),“由于東亞地區的水熱氣候條件,植物死亡后埋藏在地層中的有機質(zhì)很容易腐爛,難以在上萬(wàn)年的演化中保存下來(lái),這使得我國缺少8000~1萬(wàn)年以前的從野生稻到馴化稻的鑒定方法和證據。”

那么,是否存在可長(cháng)期保存的水稻鑒定指標?能否找到長(cháng)江流域末次盛冰期野生稻的證據?可否揭示人類(lèi)馴化野生稻的過(guò)程回答其中潛在的機制?

20多年來(lái),呂厚遠和團隊一直在試圖回答這些問(wèn)題,他們的辦法是用“植硅體”微化石。“植硅體是充填在高等植物細胞組織中的二氧化硅顆粒,它數量多、分布廣,1克葉子中能夠產(chǎn)生幾萬(wàn)粒;而且二氧化硅跟玻璃一樣能夠保存很久,不管是被動(dòng)物吃掉排泄還是遇火焚燒,都能在土壤中沉淀下來(lái)。”論文第一兼通訊作者張健平向《中國科學(xué)報》解釋說(shuō)。

更關(guān)鍵的是,呂厚遠表示,像人的“指紋”一樣,不同植物的植硅體有著(zhù)不同的形態(tài)特點(diǎn)。比如水稻植硅體是帶有魚(yú)鱗狀紋的扇型、竹子是長(cháng)鞍型、蘆葦是盾型……

呂厚遠和團隊從上世紀80年代末起就開(kāi)始研究植硅體,在中國可謂“一枝獨秀”。他們跑遍全國東南西北,不僅采集了不同氣候帶的表土土壤樣品,分析不同植被帶植硅體組合特征和分布規律,還采集了數千種植物樣品,請植物學(xué)家幫助鑒定后,進(jìn)行植硅體分析,并畫(huà)了成套的現代植硅體的素描圖,做成了圖版,出版了植硅體研究專(zhuān)著(zhù),做成了許多套顯微鏡片子,每年都會(huì )吸引很多國內外的學(xué)生前來(lái)學(xué)習。

這套技術(shù)在我國多個(gè)遺址的考古工作中都展示出非凡的戰績(jì),如鑒定出我國青海“東方龐貝”喇家遺址的“面條”是由黍粟制作的,河北武安磁山考古遺址植物遺存為黍(黃米)。這套農作物植硅體鑒定方法還被寫(xiě)入歐美多所大學(xué)教科書(shū)。

然而,由于野生稻和馴化稻的植硅體屬于“同類(lèi)”,要鑒定出它們的演化差異卻是難上加難。


浙江下湯遺址,呂厚遠(右一)等在聽(tīng)考古專(zhuān)家講剖面。上山文化分布在浙江省,下湯遺址屬于上山文化。地質(zhì)地球所供圖

建立“新標準”

早在1998年,呂厚遠在分析東海大陸架鉆孔樣品時(shí),就發(fā)現在1.3萬(wàn)多年前的地層中有水稻植硅體。根據當時(shí)有限的現代野生稻、馴化稻樣品的分析,他發(fā)現馴化稻植硅體中的“魚(yú)鱗紋”通常大于等于9個(gè),而野生到中則多數少于9個(gè)。但當時(shí)的技術(shù)和有限的化石數量很難回答野生稻動(dòng)何時(shí)開(kāi)始馴化的問(wèn)題。

2017年,呂厚遠與他的學(xué)生用植硅體魚(yú)鱗紋數量的判別方法,發(fā)現上山遺址文化層中的水稻馴化時(shí)間可追溯到9400年前,并認為作物馴化是一個(gè)漫長(cháng)的過(guò)程,應該有更早的從野生到馴化的記錄。

如何找到更早的野生稻的證據,區分野生稻與馴化稻的差別,并建立一套國際認可的指標呢?

“我們花了很大力氣回答這個(gè)問(wèn)題,需要和許多單位合作,獲得野生稻的樣品,在我曾經(jīng)負責的中國科學(xué)院的‘碳專(zhuān)項’項目中,有武漢植物園等植物專(zhuān)業(yè)的團隊參加,提供了難得的獲得樣品的機會(huì )。”呂厚遠說(shuō)。

研究團隊不僅采集了野外不同年代地層中的土壤,帶到實(shí)驗室通過(guò)化學(xué)溶液處理等方法把植硅體分離出來(lái)進(jìn)行鑒定;還從海南、江西等地采集很多現在的野生稻植物、土壤進(jìn)行分析,并化身“農民”,通過(guò)大棚實(shí)驗培植野生稻,排除馴化基因,然后一個(gè)個(gè)葉片進(jìn)行鑒定,取得了大量的可重復檢驗的數據。

基于此,他們建立了一套量化標準:魚(yú)鱗紋數量大于等于9的扇型植硅體的比例達到40%,就屬于馴化稻;反之,就是野生稻。
研究團隊還進(jìn)一步解釋了魚(yú)鱗紋數量與水稻馴化程度相關(guān)的原因。野生稻常年生長(cháng)在水里,馴化稻要定期排水,因此水稻卷葉是人類(lèi)育種過(guò)程中選擇的農藝性狀。隨著(zhù)干旱程度增加,水稻卷葉可以反復失水、膨脹等,使得魚(yú)鱗紋增加。

為了確保測年的準確性,這項研究的測年由國內外4個(gè)實(shí)驗室共同參與,相互驗證。“光釋光測年主要測沉積物埋藏的年代,使用了小測片、單顆粒的方法,結合年代模型解決了地層擾動(dòng)的問(wèn)題。結合植硅體碳14測年。兩種測年方法可以相互支持,來(lái)證明年代的可靠性。”論文共同通訊作者、山東臨沂大學(xué)教授于祿鵬介紹。

一系列的跨學(xué)科研究表明,上山文化遺址記錄了東亞水稻從野生到馴化的連續過(guò)程,野生稻早在約10萬(wàn)年前就在這里生長(cháng),約2.4萬(wàn)年前的氣候寒冷期開(kāi)始作為采集資源被人類(lèi)初步利用,約1.3萬(wàn)年前開(kāi)始了野生稻馴化前的栽培,最終在約1.1萬(wàn)年前實(shí)現馴化,標志著(zhù)東亞稻作農業(yè)的起源。

上山文化遺址發(fā)現的水稻殼的植硅體(前三排是不同魚(yú)鱗紋數量的扇型植硅體)。地質(zhì)地球所供圖

就像“開(kāi)盲盒”

“上山文化申遺最重要的內核就是稻作起源,新研究為上山文化作為稻作農業(yè)起源地提供了強大的支撐和關(guān)鍵性的科學(xué)依據,將有助于當地申遺工作的推進(jìn)。”論文共同通訊作者、浙江省文物考古研究所研究員蔣樂(lè )平表示,

國際審稿人認為,距今1.1萬(wàn)年前開(kāi)始的東亞上山文化稻作農業(yè)起源,與西亞小麥、大麥開(kāi)發(fā)、利用與馴化的時(shí)間幾乎同步。這種同步意味著(zhù)全球氣候變化、景觀(guān)變化、以及文化交流和傳承在農作物起源中發(fā)揮了重要作用。

自2005年在地質(zhì)地球所讀研究生開(kāi)始,張健平就在開(kāi)展植硅體的研究了。談及研究中的酸甜苦辣,他直言:“跑野外的苦累不算啥,等待論文修改意見(jiàn)的時(shí)間才是最焦慮的,生怕任何一個(gè)細節影響到了文章的發(fā)表。”

在兩年的時(shí)間里,張健平與研究團隊都在根據審稿人的意見(jiàn)補充植硅體的研究數據,他覺(jué)得,做數據研究就像“開(kāi)盲盒”,不到做完所有數據,做出一張完整的圖片,最后結果會(huì )呈現出什么樣子完全不清楚。“有時(shí)候可能‘盲盒’開(kāi)出來(lái)結果特別好,和之前的認知完全一樣,就可以很快地寫(xiě)出來(lái)送去發(fā)表,但如果和預想的不一樣,就要換思路重新對樣品進(jìn)行大量分析。不到發(fā)表的最后一刻,我們的心情都是折磨的。”他說(shuō)。

不過(guò),張健平坦言,最甜的還是成果被接受的時(shí)候,“獲得了國際專(zhuān)家的認可,感覺(jué)自己的工作是值得的,做了一些有意義的事情”。

新的研究計劃正在醞釀,呂厚遠表示,關(guān)于水稻馴化和起源問(wèn)題的仍有許多謎題待回答,例如是什么基因在控制水稻魚(yú)鱗紋的變化?多年生的普通野生稻是如何轉變?yōu)橐荒晟⑼ㄟ^(guò)種子繁殖的野生稻?水稻的起源是一次還是多次?是單點(diǎn)馴化還是多點(diǎn)馴化?馴化過(guò)程是迅速完成的還是經(jīng)歷了漫長(cháng)的歲月?他希望進(jìn)一步開(kāi)展跨學(xué)科研究,探索上山文化與其他地區例如江西仙人洞、吊桶環(huán)遺址等在地質(zhì)環(huán)境上的差異,進(jìn)一步回答這些問(wèn)題。


上山遺址公園。上山遺址中心張國萍供圖供圖

研究團隊在上山遺址(左三為張健平、左四為呂厚遠)。地質(zhì)地球所供圖

江西的野生稻。地質(zhì)地球所供圖

在江西野生野生稻田,呂厚遠用上山文化特有的大口盆模型采野生稻試驗。地質(zhì)地球所供圖

研究團隊在浙江井頭山遺址利用地球物理勘探方法(電法、磁法等)尋找地下考古文化地層與自然地層關(guān)系,突然大雨,到棚里暫時(shí)休息(左一為張健平)。地質(zhì)地球所供圖

相關(guān)論文信息:
https://www.science.org/doi/10.1126/science.ade4487

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